Episodios: | 30 |
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En la tercera temporada se realizaron 30 nuevos episodios, que se comenzaron a emitir en Septiembre de 1986, normalmente los Lunes y los Martes, y el resto de días se emitían episodios antiguos.
Los nuevos episodios tienen lugar después de la película The Transformers: The Movie.
Para la tercera temporada se usó otra nueva secuencia de título, actualizada con los personajes del tercer año, y se usó otra una nueva versión de la música.
Los episodios de la primera y segunda temporadas conservaban los títulos de apertura y créditos de cierre, pero se grabó sobre ellos la nueva música.
Los episodios de la miniserie "Five Faces of Darkness" tenían sus propios títulos de apertura, que adaptaban algunas de las escenas, pero la música era la misma.
A partir del episodio 89, se introducen los nuevos equipos especiales. Al igual que el año anterior, parece estar sincronizado con la aparición de los juguetes para las fiestas de Navidad de ese año.